Os cordados são animais deuterostômios e com sistema digestivo completo, com glândulas anexas.
Os urocordados captam seus alimentos através da filtragem da água pelas fendas branquiais, alcança o estômago, em seguida o intestino, terminando no ânus que se abre no átrio, localizado ao redor da faringe, responsável por recolher as excretas.
Nos cefalocordados, as fendas branquiais também filtram a água e captam o alimento, que é retido pela faringe e encaminhado ao intestino.
Quanto aos vertebrados, existem herbívoros, carnívoros e onívoros. Possuem o tubo digestivo completo, com língua, pâncreas, vesícula biliar, glândulas salivares e, geralmente, dentes.
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Fontes:
http://www.algosobre.com.br/biologia/filo-chordata.html
http://www.biomania.com.br/bio/conteudo.asp?cod=3237